Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms