Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms