Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HSF1Q00613 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms