Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms