Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms