Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
OTX2P32243 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
OTX2P32243 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OTX2P32243 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OTX2P32243 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OTX2P32243 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OTX2P32243 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
OTX2P32243 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OTX2P32243 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
OTX2P32243 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
OTX2P32243 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OTX2P32243 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OTX2P32243 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
OTX2P32243 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OTX2P32243 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OTX2P32243 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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OTX2P32243 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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OTX2P32243 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OTX2P32243 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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