Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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