Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XBP1P17861 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XBP1P17861 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XBP1P17861 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XBP1P17861 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XBP1P17861 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XBP1P17861 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms