Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms