Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms