Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIOO75962 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms