Protein–RNA interactions for Protein: O75368

SH3BGRL, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRLO75368 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRLO75368 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms