Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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MTSS1O43312 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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MTSS1O43312 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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MTSS1O43312 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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MTSS1O43312 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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