Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBTB39O15060 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBTB39O15060 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms