Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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