Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TARSL2A2RTX5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms