Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms