Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms