Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLKQ9UBT6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLKQ9UBT6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLKQ9UBT6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLKQ9UBT6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLKQ9UBT6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLKQ9UBT6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLKQ9UBT6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLKQ9UBT6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLKQ9UBT6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLKQ9UBT6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLKQ9UBT6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLKQ9UBT6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLKQ9UBT6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms