Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC88CQ9P219 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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CCDC88CQ9P219 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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CCDC88CQ9P219 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCDC88CQ9P219 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCDC88CQ9P219 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCDC88CQ9P219 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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