Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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VAPAQ9P0L0 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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VAPAQ9P0L0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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VAPAQ9P0L0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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VAPAQ9P0L0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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VAPAQ9P0L0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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VAPAQ9P0L0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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VAPAQ9P0L0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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VAPAQ9P0L0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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