Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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