Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-5Q9HDB9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms