Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms