Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms