Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms