Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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