Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

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Length 605 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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NEIL3Q8TAT5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL3Q8TAT5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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