Protein–RNA interactions for Protein: Q8N159

NAGS, N-acetylglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGSQ8N159 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NAGSQ8N159 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms