Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q6P435 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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