Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms