Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP40Q5TG30 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms