Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AL365181.2-201ENST00000606343 3222 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TP53AIP1-206ENST00000602346 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CNOT4-203ENST00000361528 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 EVL-214ENST00000555048 1715 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MEIS2-206ENST00000424352 2917 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 LBHD1-204ENST00000431002 2915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TMEM220-201ENST00000341871 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NTNG1-207ENST00000370073 3347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms