Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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