Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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E2F4Q16254 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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E2F4Q16254 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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E2F4Q16254 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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