Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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