Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCM1Q15154 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms