Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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LAMB3Q13751 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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LAMB3Q13751 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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LAMB3Q13751 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms