Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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