Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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