Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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