Protein–RNA interactions for Protein: Q13166

CATR1, CATR tumorigenic conversion 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATR1Q13166 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CATR1Q13166 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms