Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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