Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms