Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FOXI1Q12951 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms