Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COX10Q12887 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COX10Q12887 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COX10Q12887 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COX10Q12887 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COX10Q12887 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COX10Q12887 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COX10Q12887 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COX10Q12887 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COX10Q12887 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COX10Q12887 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COX10Q12887 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COX10Q12887 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COX10Q12887 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COX10Q12887 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COX10Q12887 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COX10Q12887 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COX10Q12887 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COX10Q12887 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms