Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CNTN1Q12860 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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