Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FOXO1Q12778 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FOXO1Q12778 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FOXO1Q12778 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FOXO1Q12778 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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