Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233 ms