Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BNC1Q01954 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms